Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casq1O09165 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casq1O09165 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casq1O09165 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casq1O09165 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Casq1O09165 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casq1O09165 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casq1O09165 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casq1O09165 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casq1O09165 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Casq1O09165 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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