Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mesp2O08574 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mesp2O08574 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mesp2O08574 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms