Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
U90926O08546 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
U90926O08546 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
U90926O08546 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
U90926O08546 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
U90926O08546 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
U90926O08546 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
U90926O08546 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
U90926O08546 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
U90926O08546 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
U90926O08546 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
U90926O08546 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
U90926O08546 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
U90926O08546 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
U90926O08546 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
U90926O08546 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
U90926O08546 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
U90926O08546 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
U90926O08546 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
U90926O08546 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
U90926O08546 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
U90926O08546 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
U90926O08546 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
U90926O08546 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
U90926O08546 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
U90926O08546 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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U90926O08546 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
U90926O08546 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
U90926O08546 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
U90926O08546 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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U90926O08546 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
U90926O08546 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
U90926O08546 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
U90926O08546 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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U90926O08546 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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U90926O08546 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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U90926O08546 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
U90926O08546 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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U90926O08546 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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U90926O08546 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
U90926O08546 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
U90926O08546 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
U90926O08546 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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U90926O08546 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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U90926O08546 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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U90926O08546 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
U90926O08546 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
U90926O08546 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
U90926O08546 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
U90926O08546 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
U90926O08546 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
U90926O08546 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
U90926O08546 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
U90926O08546 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
U90926O08546 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
U90926O08546 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
U90926O08546 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
U90926O08546 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
U90926O08546 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
U90926O08546 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
U90926O08546 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
U90926O08546 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
U90926O08546 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
U90926O08546 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
U90926O08546 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
U90926O08546 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
U90926O08546 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
U90926O08546 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
U90926O08546 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
U90926O08546 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
U90926O08546 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
U90926O08546 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
U90926O08546 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
U90926O08546 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
U90926O08546 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
U90926O08546 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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