Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Efna5O08543 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efna5O08543 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efna5O08543 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efna5O08543 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efna5O08543 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Efna5O08543 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efna5O08543 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efna5O08543 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Efna5O08543 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Efna5O08543 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Efna5O08543 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Efna5O08543 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efna5O08543 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efna5O08543 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efna5O08543 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efna5O08543 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efna5O08543 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms