Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm3488M0QW81 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms