Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3542K7N6U2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3542K7N6U2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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