Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gm38014-201ENSMUST00000193349 2612 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm45210-201ENSMUST00000206401 1577 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms