Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP2

Gm3685, Predicted gene 3685, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3685J3QPP2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms