Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5294J3QP53 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5294J3QP53 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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