Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21900J3QP38 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm21900J3QP38 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21900J3QP38 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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