Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smim18J3QNP2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim18J3QNP2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms