Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34c2J3QNM1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34c2J3QNM1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn34c2J3QNM1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c2J3QNM1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c2J3QNM1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c2J3QNM1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c2J3QNM1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c2J3QNM1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c2J3QNM1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c2J3QNM1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c2J3QNM1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c2J3QNM1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c2J3QNM1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c2J3QNM1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c2J3QNM1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c2J3QNM1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c2J3QNM1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c2J3QNM1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c2J3QNM1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c2J3QNM1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c2J3QNM1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c2J3QNM1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c2J3QNM1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn34c2J3QNM1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34c2J3QNM1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34c2J3QNM1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34c2J3QNM1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34c2J3QNM1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn34c2J3QNM1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34c2J3QNM1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c2J3QNM1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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