Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Gm20918J3QN17 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Gm20918J3QN17 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Gm20918J3QN17 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Gm20918J3QN17 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20918J3QN17 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Gm20918J3QN17 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm20918J3QN17 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm20918J3QN17 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20918J3QN17 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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