Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm6594J3QM43 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm6594J3QM43 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6594J3QM43 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6594J3QM43 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6594J3QM43 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6594J3QM43 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6594J3QM43 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6594J3QM43 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gm6594J3QM43 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6594J3QM43 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6594J3QM43 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6594J3QM43 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6594J3QM43 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6594J3QM43 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6594J3QM43 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6594J3QM43 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm6594J3QM43 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6594J3QM43 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6594J3QM43 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6594J3QM43 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6594J3QM43 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6594J3QM43 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6594J3QM43 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6594J3QM43 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6594J3QM43 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6594J3QM43 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6594J3QM43 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6594J3QM43 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6594J3QM43 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6594J3QM43 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm6594J3QM43 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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