Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp17lcG5E8I7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp17lcG5E8I7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms