Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933406M09RikG3XA12 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933406M09RikG3XA12 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms