Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hmgxb3G3X9M3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmgxb3G3X9M3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms