Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zc3h12bG3X9I7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zc3h12bG3X9I7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms