Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a3G3X939 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a3G3X939 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a3G3X939 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a3G3X939 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a3G3X939 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a3G3X939 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a3G3X939 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a3G3X939 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a3G3X939 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a3G3X939 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a3G3X939 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a3G3X939 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc9a3G3X939 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a3G3X939 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms