Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim15G3UY57 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim15G3UY57 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms