Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r167G3UW71 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r167G3UW71 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r167G3UW71 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms