Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arid4aF8VPQ2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arid4aF8VPQ2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arid4aF8VPQ2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arid4aF8VPQ2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arid4aF8VPQ2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arid4aF8VPQ2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arid4aF8VPQ2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arid4aF8VPQ2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arid4aF8VPQ2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arid4aF8VPQ2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arid4aF8VPQ2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arid4aF8VPQ2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arid4aF8VPQ2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms