Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm28305F6U473 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28305F6U473 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28305F6U473 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28305F6U473 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28305F6U473 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28305F6U473 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28305F6U473 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28305F6U473 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28305F6U473 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28305F6U473 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28305F6U473 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28305F6U473 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28305F6U473 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28305F6U473 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28305F6U473 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28305F6U473 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28305F6U473 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28305F6U473 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28305F6U473 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm28305F6U473 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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