Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lmod3E9QA62 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmod3E9QA62 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms