Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp31E9Q6Y8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp31E9Q6Y8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms