Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ythdc1E9Q5K9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdc1E9Q5K9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms