Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ApobE9Q414 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms