Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

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Length 4,418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Hectd4E9Q2E4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Hectd4E9Q2E4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Hectd4E9Q2E4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Hectd4E9Q2E4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Hectd4E9Q2E4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Hectd4E9Q2E4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hectd4E9Q2E4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hectd4E9Q2E4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hectd4E9Q2E4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hectd4E9Q2E4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hectd4E9Q2E4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hectd4E9Q2E4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hectd4E9Q2E4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hectd4E9Q2E4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hectd4E9Q2E4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hectd4E9Q2E4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hectd4E9Q2E4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hectd4E9Q2E4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hectd4E9Q2E4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hectd4E9Q2E4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hectd4E9Q2E4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hectd4E9Q2E4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hectd4E9Q2E4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hectd4E9Q2E4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hectd4E9Q2E4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hectd4E9Q2E4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hectd4E9Q2E4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hectd4E9Q2E4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hectd4E9Q2E4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hectd4E9Q2E4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hectd4E9Q2E4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hectd4E9Q2E4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms