Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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