Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r68E9Q0V3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms