Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdr1E9Q0B4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms