Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm9972E9Q053 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms