Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx60E9PZQ1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx60E9PZQ1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms