Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc62E9PVD1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms