Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syde2E9PUP1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms