Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Samd1D3YXK1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms