Protein–RNA interactions for Protein: D2EAC2

Zbed6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed6D2EAC2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbed6D2EAC2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbed6D2EAC2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms