Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clip3B9EHT4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms