Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms