Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AU015836B2RUM3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AU015836B2RUM3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms