Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PtprbB2RU80 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtprbB2RU80 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms