Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Znf518aB2RRF6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Znf518aB2RRF6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Znf518aB2RRF6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Znf518aB2RRF6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Znf518aB2RRF6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Znf518aB2RRF6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms