Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU2

Plekhd1, Pleckstrin homology domain-containing family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhd1B2RPU2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plekhd1B2RPU2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Plekhd1B2RPU2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Plekhd1B2RPU2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Plekhd1B2RPU2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plekhd1B2RPU2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Plekhd1B2RPU2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms