Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uhrf1bp1B2KF50 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Uhrf1bp1B2KF50 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms