Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn7aB1AYL1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scn7aB1AYL1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms