Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms