Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms