Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skint2A7XUX6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skint2A7XUX6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms