Protein–RNA interactions for Protein: A2RSY6

Trmt1l, TRMT1-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1lA2RSY6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trmt1lA2RSY6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trmt1lA2RSY6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trmt1lA2RSY6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trmt1lA2RSY6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trmt1lA2RSY6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trmt1lA2RSY6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trmt1lA2RSY6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trmt1lA2RSY6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt1lA2RSY6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms