Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931406B18RikA2RSL7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931406B18RikA2RSL7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms